- 首页 ＞ 红隼注释平◥台介绍
红隼注释平台介绍
平台介绍
- 红隼注释平台（Falcon）是针对VCF文件注释所打造的通用注释平台；
- 目标是■统一数据库、大幅提升注释∮速度、降低运维成本，并保障变异ㄨ位点注释的准确性。
平台特点
- 数据汇总：将巨大的数据库文件结构化，并入OB数据库，不再反复提取加载；
- 数据清洗：清洗、统一注释库文件，对处理冗余数据；
- 注释服务：提供注释Server，支持10000TPS高并发性能⊙，即秒级完成一个基因组注释中的查询工作。
支持的数』据库
|
数据库类型 |
名称 |
注释库＠ 版本 |
|
频率库 |
dbsnp |
20180418 |
|
esp |
20190423 |
|
|
Population:ExAC |
r1 |
|
|
1000genome |
20130512/20140730 |
|
|
疾病库 |
cosmic |
v76,v78 |
|
clinvar |
20210731 |
|
|
hgmd |
201701 |
|
|
gwas |
20210721/20210708 |
|
|
ENCODE |
- |
|
|
simplerepeat |
20200322 |
|
|
omim |
- |
|
|
PharmGKB |
20210811 |
|
|
HumanProteinAtlas |
v20.4 |
|
|
基础注释 |
snpeff |
v5.0e |
|
软件预测 |
dbnsfp |
4.2a |
