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                产品服务

                Sequencing services

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                HML1600代谢组

                产品介绍

                HML1600代谢组通过液相色谱串★联质谱(LC-MS/MS)技术对12种脂质亚类中1,600多种脂质代谢物进行高通量的靶向代谢组学〗检测分析,使用标准曲线结合内标进行绝对定量,覆盖各类具有重要生物学功能的脂质。HML1,600代谢︾组同时解决了脂质代谢组学验证难和传统靶向脂质代谢组学检测代谢物Ψ 少的问题,具有良好的应用价值。

                表1 HML1600覆盖的脂质◤代谢物种类

                类别

                大类

                亚类(Sub Class

                数量

                代表性物质

                甘油磷脂类Glycerophospholipids (GP)

                磷脂酰胆※碱

                P-Choline

                磷々脂酰胆碱

                Phosphatidylcholine (PC)

                ~211

                PC 16:0-16:0PC 16:0-16:1PC 16:0-18:0

                溶⊙血磷脂酰胆碱

                Lysophosphatidylcholine (LPC)

                ~24

                LPC 14:0LPC 15:0LPC 16:0LPC 16:1LPC 17:0

                磷ぷ脂酰甘油

                P-Glycerol

                磷脂酰甘油

                Phosphatidylglycerol (PG)

                ~211

                PG 16:0-16:0PG 16:0-16:1PG 16:0-18:0

                磷脂酰肌醇

                P-Inositol

                磷脂酰肌醇

                Phosphatidylinositol (PI)

                ~210

                PI 16:0-16:0PI 16:0-16:1PI 16:0-18:0PI 16:0-18:1

                磷脂酰丝】氨酸

                P-Serine

                磷脂酰丝氨酸

                Phosphatidylserine (PS)

                ~204

                PS 16:0-16:0PS 16:0-16:1PS 16:0-18:3PS 16:0-18:4

                磷脂酰乙醇胺

                P-Ethanol Amine

                磷脂酰乙醇胺

                Phosphatidylethanolamine (PE)

                ~207

                PE 16:0-16:0PE 16:0-16:1PE 16:0-18:0PE 16:0-18:1

                溶血磷脂酰乙醇胺

                Lysophosphatidylethanolamine (LPE)

                ~24

                LPE 14:0LPE 15:0LPE 16:0LPE 16:1LPE 17:0

                甘油酯类

                Glycerolipids (GL)

                二酰甘油

                Diradylglycerols

                二酰甘油

                Diacylglycerol (DAG)

                ~49

                DAG 16:0-16:0DAG 16:0-16:1DAG 16:0-18:0

                三酰甘油

                Triacylglycerols

                三酰甘油

                Triacylglycerol (TAG)

                ~464

                TAG 42:0-FA12:0TAG 42:0-FA14:0TAG 42:0-FA16:0

                固醇脂类

                Sterol Lipids (ST)

                固醇类

                Sterols

                胆固醇酯

                Cholesterol Ester (CE)

                ~26

                CE 12:0CE 14:0CE 14:1CE 15:0CE 16:0

                鞘脂类

                Sphingolipids (SP)

                神经酰胺

                Ceramides

                神经酰胺

                Ceramides (CER)

                ~13

                Cer d18:1/14:0Cer d18:1/16:0Cer d18:1/16:1

                鞘脂

                Sphingolipids

                鞘磷脂

                Sphingomyelin (SM)

                ~57

                SM 34:0SM 35:0

                 

                 

                总计

                1,600+

                 


                技术优势

                1. 超高通量:一次性靶向检测1,600多种脂」质化合物,覆盖12种脂质亚类。

                2. 高灵敏度:有效区分脂质同♀分异构,准确鉴定不同脂肪酸链种类。

                3. 准确定量:使用标准曲线与内标法进行代谢组学定量,具有卓越的准确性和精密度。

                4. 分析丰富:结合统计学分析与功能分析方法,辅助挖掘关█键代谢物及重要代谢通路。

                5. 高重现性:标准化工作流程结合内标与校准品,满足大样㊣ 本检测对重现性的高度要求。

                6. Dr. Tom交付:可通过Dr. Tom云平台交付项目数据,支持项目重分析、自定▆义绘图,还有多个分析小工具助力数据挖掘。

                7. 多组学联︽合:提供相关多组学关联分析服务(代谢组+宏基因组/16S/转录组/蛋白质组、mGWAS)。


                产品应用

                神经系统疾病研究、心脑ω血管疾病研究、营养代谢研究、脂质代谢研□ 究¤


                技术路线

                a1


                技术参数

                1. 仪器平台

                LC-MS/MS:Waters ACQUITY UPLC,SCIEX QTRAP 5500

                2. 分析软件

                自主研发的代谢组学软件包metaX[1]


                项目执行周期

                30-60个自然日


                参考文献

                [1] Wen, Bo, et al. "metaX: a flexible and comprehensive software for processing metabolomics data." BMC bioinformatics 18.1 (2017): 183.


                案例一:整合代谢组和细胞因〖子分析揭示持久性有机污染物与子宫内膜异位症之间的◣关联[1]

                研究背景:

                人类每天通过环境和饮食暴露于复杂的化学污染物混合物☆中,其中一些有可能破坏●身体的内分泌功能并导致子宫内膜异位症等生殖疾病。越来越多的流行病◥学和实验证据支持子宫内膜异位症与某些持久性有机污染物(POPs)之间有联系,然而,人们对潜在的机¤制知之甚少。

                研究设计:

                该研究招募了49名子宫内膜异位症(OMA)、26名无子宫内膜异位症的深部子宫内膜异位症(noOMA)病例、12名子宫内膜异位症无︾关的其他良性生殖√问题病例作为对照组。用高分辨率质谱仪分析血清样品中约30种多♀氯联苯(PCBs)、有机氯农药(OCPs)和全氟烷基物质(PFAS)。通过靶向代谢组学鉴定了约600种血清代谢物和脂质。使用基于ELISA的4-PLEX分析※仪分析了4种促炎细胞因子。

                研究结果:

                某些POPs(如农药㊣反式-九氯和PCB114)与OMA风险之间存在正相关。患有OMA的女性脂肪酶活性增加,鞘磷脂(SMs)和磷脂酰胆▼碱(PCs)的比例更大,一些PC的水平与OMA风险相关。据推测,SM和PC水平升】高可能有助于抑制细胞凋亡并改变脂质相关的信号通路。反过来,SMs与PC的比率是神经酰胺合成SM的指标,在此被发现△是OMA的潜在预测指标。综合分析阐明了在患」有严重OMA的病例中POPs(如农药反式-九氯和PCB114)、脂解活性和炎症的内源性标志物上调。

                a2

                图1 用于鉴〖定与OMA相关的潜在变量簇的POP暴露和血清中脂质代谢物和←细胞因子的二级结构】综合分析的桑基图


                案例二:多囊卵【巢综合征妊娠的代谢组学分析可识别低出生体重的独█特代谢特征和潜在的预测生物标志物[2]

                研究背景:

                多囊卵巢综合征(PCOS)是一@ 种具有内分泌/代谢紊乱临床特征的复杂综合征。各种代□谢物与PCOS有显著关联;然而,缺∴乏比较患有和没有PCOS的♀孕妇的代谢特征的研究。在这项研究中,对PCOS妇女和年龄↓的血液样本和∩BMI匹配对照组进行了代谢组学分析,以确□ 定两组之间的代谢差异并确定其♂与妊娠结局的关联。

                研究设计:

                利用高通量靶向代谢组学对16名PCOS和52名√处于妊娠中期的健康女性的血浆样品中的脂质代谢物进行了检测。

                研究结果:

                与健康对照组相比,PCOS妇女的出生婴儿体☆重较低。作为一个群体,妊娠中期和分娩时〇的收缩压(SBP)与出生体重呈负相关。回归模型∴显示PCOS组中甘油三酯C20:4_C34:3和C18:2_C38:6显著增加。富集分析显示PCOS组中花生四〓烯酸,亚油酸和棕榈酸的甘油三酯显著升高。代谢组结果■显示,分娩时SBP、己糖神▃经酰胺(d18:2/24:0)、神经酰胺(d18.0/24.1)、丝氨酸以及低出生体重(≤2500克)所有预测因子等指标『与婴儿出生体重相关。PCOS怀孕导致婴儿出生体重较低,可能与其富①含特定的甘油三酯和不饱和脂肪酸有关。

                a3

                图2 低出生体重(≤2,500克)的ROC曲线


                参考文献

                [1] Matta K, et al. Associations between persistent organic pollutants and endometriosis: A multiblock approach integrating metabolic and cytokine profiling. Environment international. 2021, 158:106926.

                [2] Atkin SL, et al. Metabolomic profiling of pregnancies with polycystic ovary syndrome Identifies a unique metabolic signature and potential predictive Biomarkers of low birth weight. Frontiers in endocrinology. 2021, 12: 638727.


                典型⌒ 结果展示

                a4


                1. 重复数要求

                样本类型

                重复次数要求

                植物、微生物、细胞样本

                ≥ 6

                动物样本

                ≥ 10

                临床样本

                ≥ 30

                每组样本的生物学重复次数要求如下,重复次数越多越好。


                2. 送样】量要求

                样品类型

                建议送样量(每例)

                血清、血浆、尿液

                100 μL

                动物或临床组织●▼、粪便、肠道内容物、微生物菌体

                50 mg

                细胞(需每份样本细胞数目保持一◎样)

                1×107

                培养液、发酵液

                  500 μL


                Q1:不同批次实验检测的HML1600代谢组数据可以一起分〗析吗?

                A1:需要一起进行比较ξ分析的样本,需要同时执行,一起进∮行样本制备㊣,一起上机检测。分批次实验检︼测的话,需要对不同批次上机的样本进行整体质量控制,需要进行多批次】数据的校正,说明各批次之间的数据具有可比性。华大暂不提供多批々次实验检测数据的质控和校正服务。


                Q2:脂质组学检测不到的代谢物,HML1600代谢『组可以检测到吗?

                A2:非靶向脂质组学检测不到的代谢物,HML1600代谢组是◇可能能检测到的。HML1600代谢组是靶向代谢组学◥技术,检测更有针对性,准确度、灵敏■度更高,对于目标代谢物、低含量▓代谢物的检出能力更强。


                深圳华大科技(总部)

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